Музей истории Томского государственного университета основан в 1984 году. В его фондах собраны документальные свидетельства различных периодов истории университета. Объем фондов – около 10 000 единиц хранения.

Экспозиция знакомит посетителей с основными этапами истории одного из старейших университетов России и рассказывает о людях, которые внесли значительный вклад в развитие науки и образования в Сибири. Особое внимание уделяется формированию личных фондов выдающихся ученых. Однако материальные свидетельства «рядовых» участников истории вуза также хранятся в музее.

Среди экспонатов немало уникальных реликвий. Например, интерьер кабинета профессора конца XIX – начала XX века. В нем представлены подлинные вещи и предметы быта, принадлежавшие первому ректору Н. А. Гезехусу (письменный стол), зоологу Г. Э. Иоганзену (шкаф, тумбочка, чернильный прибор), физику Ф. М. Капустину (настольная лампа), математику Ф. Э. Молину (пенсне, газеты, счета из магазинов), медикам М. Г. Курлову (рукопись) и П. В. Бутягину (форменный сюртук), юристу И. А. Малиновскому (семейная фотография в рамке).

Фонды музея и его библиотека используются в научной работе ученых и студентов университета, для создания видеофильмов, интернет-ресурсов и прочего. Экспозиция открыта не только для сотрудников и студентов университета, но и для иных категорий посетителей музеев ТГУ.